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MASS ARRAY 基因分型服務(wù)

 更新時間:2019-02-21 點擊量:2667

質(zhì)譜法基因分型技術(shù)簡介

DNA質(zhì)譜陣列基因分析系統(tǒng)以其通量高、自動化、靈活、結(jié)果準(zhǔn)確、實驗成本低廉等諸多優(yōu)勢成為了大學(xué)、醫(yī)學(xué)生物學(xué)研究所、生物技術(shù)公司、制藥企業(yè)、疾控中心等機(jī)構(gòu)所推崇的研究工具。應(yīng)用領(lǐng)域涵蓋醫(yī)學(xué)及轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)、分子生物學(xué)、基因組學(xué)、表觀遺傳學(xué)、農(nóng)業(yè)遺傳育種及轉(zhuǎn)基因技術(shù)等相關(guān)領(lǐng)域。

檢測儀器信息

Sequenom MassArray時間飛行質(zhì)譜生物芯片系統(tǒng)是為基因組學(xué)研究提供兼顧靈敏度和特異服務(wù)的中高通量技術(shù)平臺,廣泛地應(yīng)用于遺傳突變檢測、SNP分型以及DNA甲基化定量分析研究,是目前唯yi采用質(zhì)譜法進(jìn)行直接檢測的設(shè)備。

Sequenom MassArray系統(tǒng)反應(yīng)體系為非雜交依賴性,不需要各種標(biāo)記物,實驗設(shè)計靈活,更可實現(xiàn)高達(dá)40重反應(yīng),是目前市場上擁有高性價比的產(chǎn)品。

Sequenom MassArray特定SNP位點檢測服務(wù)采用專業(yè)的引物設(shè)計和基因分型軟件,可對95%以上已被證實的SNP進(jìn)行實驗設(shè)計,特別適合于SNP位點小于200個,樣本量大于500份的項目。實驗過程無需熒光標(biāo)記,大大降低每次基因型分析的成本。


 

檢測原理
Sequenom MassARRAY® 分子量陣列技術(shù)是Sequenom 公司推出的世界上的基因分析工具,通過引物延伸或切割反應(yīng)與靈敏、可靠的MALDI-TOF質(zhì)譜技術(shù)相結(jié)合,經(jīng)過PCR擴(kuò)增,SAP酶處理, 延伸引物單堿基延伸,樹脂除鹽純化, 芯片點樣, 質(zhì)譜檢測等實驗步驟,終使用Typer4.0 軟件分析實驗數(shù)據(jù),獲得基因分型結(jié)果。 
具體原理:Sequenom MassArray系統(tǒng)主要是利用基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時間質(zhì)譜 (MALDI-TOF MS) 進(jìn)行分析,即PCR擴(kuò)增產(chǎn)物或者預(yù)處理樣本在延伸單堿基后,將制備的樣品分析物與芯片基質(zhì)共結(jié)晶,將該晶體放入質(zhì)譜儀的真空管,而后用瞬時納秒 (10-9s) 強(qiáng)激光激發(fā),由于基質(zhì)分子經(jīng)輻射所吸收的能量,導(dǎo)致能量蓄積并迅速產(chǎn)熱,從而使基質(zhì)晶體升華,核酸分子就會解吸附并轉(zhuǎn)變?yōu)閬喎€(wěn)態(tài)離子,產(chǎn)生的離子多為單電荷離子,這些單電荷      離子在加速電場中獲得相同的動能,進(jìn)而在一非電場漂移區(qū)內(nèi)按照其質(zhì)荷比率得以分離,在真空小管中飛行到達(dá)檢測器。 
檢測應(yīng)用 
中高通量SNP基因型分析
GWAS及二代測序驗證
腫瘤體細(xì)胞基因突變譜分析
基因表達(dá)定量及目標(biāo)基因CNV分析
DNA甲基化定位定量
病原體分子分型
技術(shù)優(yōu)勢
定制靈活:可以自由選擇感興趣的SNP位點一張芯片上,樣本的數(shù)量和位置可以自由選擇一張芯片上,樣本和SNP位點的配對可以自由選擇。
分析準(zhǔn)確:直接檢測待測物分子量,準(zhǔn)確度超過99.7%。質(zhì)譜技術(shù)靈活檢測PCR實驗失敗或三等位基因的存在??芍貜?fù)性高,每個樣品將要檢測到SNP位點適合精細(xì)定位和芯片實驗的后續(xù)研究。
高通量檢測:一張芯片上可完成384個樣品的多重iPLEX GOLD實驗;每個反應(yīng)孔高可實現(xiàn)多達(dá)40重反應(yīng);每天可進(jìn)行高達(dá)十萬次基因型分析。
檢測服務(wù)流程
1、客戶提供DNA或者生物樣本,并需要檢測SNP位點(rs編號) 
2、設(shè)計引物(包括PCR擴(kuò)增引物和單堿基延伸引物) 
3、樣本制備PCR擴(kuò)增、SAP處理、單堿基延伸 
4、點樣制備檢測用芯片陣列 
5、MALDI-TOF質(zhì)譜檢測 
6、數(shù)據(jù)分析、給出分型報告 

樣本要求 
基因組DNA: 總量大于10 ng(視檢測位點數(shù)量遞增) 
A260/280在1.8-2.0 
A260/230大于1.8 
服務(wù)流程 
1、提交項目課題相關(guān)需求和資料。 
2、與我們的專業(yè)技術(shù)團(tuán)隊討論項目細(xì)節(jié)。 
3、根據(jù)討論后的意見對實驗方案進(jìn)行修改。 
4、雙方均滿意并達(dá)成一致,簽訂技術(shù)服務(wù)合同。 
5、開展實驗,按期完成合同規(guī)定的內(nèi)容。 
6、結(jié)題,提供實驗原始結(jié)果和分析結(jié)果、實驗流程、實驗條件等等。 
咨詢與訂購 
感謝您選擇我們的服務(wù),如果您有任何問題,請聯(lián)系我們,我們將竭誠為您解答和服務(wù)。 

 

 

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